1 часть.
Alice (Элис) приходит в себя лежа на полу в ванной и мучительно пытается вспомнить кто же она такая. Едва девушка успевает вытереться и одеться, как в дом врывается толпа вооружённых до зубов людей - специальный военизированный отряд, засланный корпорацией Umbrella с целью выяснения обстоятельств аварии в подземной лаборатории The Hive (Улей). Они объясняют ошарашенной Элис, что она агент корпорации, обеспечивавший прикрытие этого самого лабораторного комплекса. T-Вирус - секретная разработка корпорации Umbrella вырвался на свободу, превратив работников лаборатории в зомби, живых мертвецов, которые сохраняют простейшие двигательные функции и бесцельно бродят по лаборатории, пожирая всё живое на своём пути. Главный компьютер комплекса, Red Queen (Красная Королева), который, как выясняется позже, любит пошалить, закрывает все входы и выходы, чтобы не дать вирусу вырваться за пределы лаборатории. Вскрыв Улей и столкнувшись лицом к лицу с толпой голодных зомби и мутантов, отряд заметно редеет. Оказавшись в этой "стране чудес", Элис вынуждена бороться за свою жизнь и жизнь всего человечества с жуткими монстрами, озверевшими коллегами и маленькой капризной Красной Королевой. Это удаётся ей ровно наполовину...
2 часть.
T-Вирус на свободе, Ракун-сити заражен почти полностью. Umbrella окружила город толстой стенкой и не хочет никого из него выпускать. Alice (Элис) тоже на свободе и очень хочет уехать из проклятого города. Снова их интересы не совпадают, но на этот раз Элис не одинока, её поддерживает никто иной как Jill Valentine (Джилл Валентайн) и Carlos Olivera (Карлос Оливера). На этом список знакомых лиц не заканчивается, также в фильме можно лицезреть Немезиса, который в течение всего фильма исправно выполняет свою основную функцию - пытается убить главных героев, однако под конец фильма он как-то странно размякает под взором прекрасных глаз Элис. Не обошлось и без маленькой девочки, здесь она представлена дочкой создателя Красной Королевы, Angie Ashford (Энджи Эшфорд). И, конечно, "просто так прохожий, парень чернокожий", совершенно случайно оказавшийся в самом сердце событий. Одним словом, полный укомплектованный набор среднестатистического американкого боевика. И заканчивается фильм соответственно: Элис вырезает полкорпорации при помощи шариковой ручки и усилия воли и уезжает со своими новыми друзьями, моргнув на прощание в камеру своим радиактивным глазом
3 часть.
Элис с очередной группой жаждущих добра и справедливости людей отправляется в длинный путь через пустыню Невада на Аляску. В то время как за ней охотятся миньоны коварного Доктора Айзекса, зомби, жаждущие её плоти, и лабораторные крысы, жаждущие её крови, Элис жаждет лишь одного - мести.